حسن نجفی گونجوک تحصیلات خود را در رشته ریاضی و فیزیک آغاز کرد و پس از اخذ مدرک دیپلم، وارد حوزه آموزش عالی در زمینه فناوری اطلاعات شد. وی موفق به دریافت مدرک کاردانی سختافزار کامپیوتر و سپس کارشناسی شبکههای کامپیوتری گردید. این بخش از تحصیلات او زمینه آشنایی با مباحث فنی و تخصصی رایانه و شبکه را فراهم کرد.
در ادامه مسیر علمی، وی به تحصیل در حوزه علوم اسلامی پرداخت و مدرک کارشناسی معارف اسلامی را از مؤسسه آموزشی و پژوهشی امام خمینی (ره) دریافت کرد. همچنین تحصیلات حوزوی خود را در حوزه علمیه خراسان ادامه داده و به سطح سه حوزه علمیه رسیده است.
در کنار تحصیلات دانشگاهی و حوزوی، وی مدرک مشاوره خانواده با رویکرد سیستمی را نیز کسب کرده است؛ رویکردی که خانواده را بهعنوان مجموعهای از روابط متقابل بررسی میکند و بر شناخت الگوهای ارتباطی و تعامل میان اعضای خانواده تأکید دارد.